Гистограмма Matplotlib

Так у меня есть небольшая проблема. У меня есть набор данных в scipy, который уже находится в формате гистограммы, поэтому у меня есть центр ячеек и количество событий на ячейку. Как я могу теперь построить график в виде гистограммы. Я пробовал просто делать 

bins, n=hist()

но это не так. Какие-нибудь рекомендации?

5 95
python numpy matplotlib scipy

5 ответов:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

mu, sigma = 100, 15
x = mu + sigma * np.random.randn(10000)
hist, bins = np.histogram(x, bins=50)
width = 0.7 * (bins[1] - bins[0])
center = (bins[:-1] + bins[1:]) / 2
plt.bar(center, hist, align='center', width=width)
plt.show()

enter image description here

объектно-ориентированный интерфейс также прост:

fig, ax = plt.subplots()
ax.bar(center, hist, align='center', width=width)
fig.savefig("1.png")

если вы используете пользовательские (непостоянные) бункеры, вы можете передать вычислить ширину с помощью np.diff, передайте ширины к ax.bar и использовать ax.set_xticks чтобы пометить края бункера:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

mu, sigma = 100, 15
x = mu + sigma * np.random.randn(10000)
bins = [0, 40, 60, 75, 90, 110, 125, 140, 160, 200]
hist, bins = np.histogram(x, bins=bins)
width = np.diff(bins)
center = (bins[:-1] + bins[1:]) / 2

fig, ax = plt.subplots(figsize=(8,3))
ax.bar(center, hist, align='center', width=width)
ax.set_xticks(bins)
fig.savefig("/tmp/out.png")

plt.show()

enter image description here

213

Если вы не хотите, баров вы можете построить его, как это:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

mu, sigma = 100, 15
x = mu + sigma * np.random.randn(10000)

bins, edges = np.histogram(x, 50, normed=1)
left,right = edges[:-1],edges[1:]
X = np.array([left,right]).T.flatten()
Y = np.array([bins,bins]).T.flatten()

plt.plot(X,Y)
plt.show()

histogram

18

Я знаю, что это не ответ на ваш вопрос, но я всегда оказываюсь на этой странице, когда я ищу решение matplotlib для гистограмм, потому что простой histogram_demo был удален со страницы галереи примеров matplotlib.

вот решение, которое не требует numpy чтобы быть импортированы. Я только импортирую numpy для генерации данных x для построения графика. Он опирается на функцию hist вместо функции bar как в ответ by @unutbu.

import numpy as np
mu, sigma = 100, 15
x = mu + sigma * np.random.randn(10000)

import matplotlib.pyplot as plt
plt.hist(x, bins=50)
plt.savefig('hist.png')

enter image description here

также проверить matplotlib галерея и примеры matplotlib.

9

Если вы используете pandas:

pandas.DataFrame({'x':hist[1][1:],'y':hist[0]}).plot(x='x',kind='bar')
5

Я думаю, что это может быть полезно для кого-то.

функция гистограммы Numpy, к моему раздражению (хотя, я ценю, что для этого есть веская причина), возвращает края каждого Бина, а не значение Бина. Хотя это имеет смысл для чисел с плавающей запятой, которые могут лежать в интервале (т. е. центральное значение не является сверхзначимым), это не является желаемым выходом при работе с дискретными значениями или целыми числами (0, 1, 2 и т. д.). В частности, длина БИНС вернулся из НП.гистограмма не равна длине отсчетов / плотности.

чтобы обойти это, я использовал np.оцифровка для квантования входных данных и возврата дискретного числа ячеек вместе с долей отсчетов для каждой ячейки. Вы можете легко редактировать, чтобы получить целое число подсчетов.

def compute_PMF(data)
    import numpy as np
    from collections import Counter
    _, bins = np.histogram(data, bins='auto', range=(data.min(), data.max()), density=False)
    h = Counter(np.digitize(data,bins) - 1)
    weights = np.asarray(list(h.values())) 
    weights = weights / weights.sum()
    values = np.asarray(list(h.keys()))
    return weights, values
####

ссылки:

[1] https://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.histogram.html

[2] https://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.digitize.html

0