Настройка интерфейса Java R (JRI) в Windows


Я следовал руководствам в интернете и смотрел вопросы по stackoverflow, но я все еще не могу настроить JRI на Windows.

Вот шаги, которые я предпринял:

1) Установить R

2) выполнить install.packages("rJava") в R для установки rJava

3) Создайте системную переменную R_HOME со значением C:Program FilesRR-3.1.2

4) Добавьте в мою переменную PATH следующее: C:Program FilesRR-3.1.2binx64;C:UsersUSERNAMEDocumentsRwin-library3.1rJavajrix64

[10]}5) добавил JRI.jar (находится в C:UsersUSERNAMEDocumentsRwin-library3.1rJavajri) как зависимость в IntelliJ

6) Установите виртуальную машину опции в IntelliJ to -Djava.library.path=C:UsersUSERNAMEDocumentsRwin-library3.1rJavajrix64

7) запустите R и выполните library("rJava")

8) запустите мою программу, чтобы проверить, все ли настроено

Получаем следующую ошибку:

#
# A fatal error has been detected by the Java Runtime Environment:
#
#  EXCEPTION_ACCESS_VIOLATION (0xc0000005) at pc=0x000000006c726096, pid=5860, tid=6932
#
# JRE version: Java(TM) SE Runtime Environment (8.0_31-b13) (build 1.8.0_31-b13)
# Java VM: Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (25.31-b07 mixed mode windows-amd64 compressed oops)
# Problematic frame:
# C  [R.dll+0x26096]
#
# Failed to write core dump. Minidumps are not enabled by default on client versions of Windows
#
# An error report file with more information is saved as:
# C:UsersUSERNAMEDocumentsProjecths_err_pid5860.log
#
# If you would like to submit a bug report, please visit:
#   http://bugreport.java.com/bugreport/crash.jsp
# The crash happened outside the Java Virtual Machine in native code.
# See problematic frame for where to report the bug.
#

Если я удалю опцию VM так, что java.библиотека.путь не указан, то я получаю следующую ошибку:

Cannot find JRI native library!
Please make sure that the JRI native library is in a directory listed in java.library.path.

java.lang.UnsatisfiedLinkError: no jri in java.library.path
    at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(ClassLoader.java:1865)
    at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Runtime.java:870)
    at java.lang.System.loadLibrary(System.java:1119)
    at org.rosuda.JRI.Rengine.<clinit>(Rengine.java:19)
    at com.coagsm.cs.fyp.Test.<clinit>(Test.java:11)
    at java.lang.Class.forName0(Native Method)
    at java.lang.Class.forName(Class.java:260)
2 3

2 ответа:

Как вы создаете экземпляр Rengine?

Это должно быть примерно так:

Rengine rengine = new Rengine(args, false, null);

Где, args может быть из вашего основного метода.

Дайте мне знать, если это сработает!

Последним (2018) для меня было сделать это : -

export R_HOME=$(R RHOME)

Затем скомпилируйте это: -

String[] enginargs = {"--no-save"};
REngine engine = org.rosuda.REngine.JRI.JRIEngine.createEngine(enginargs, null, false);

try {
    engine.parseAndEval("print(\"Hello from R\");");
}
catch(Exception e ) {
    System.err.println("OOps:-" + e.getMessage());
}
finally {
    engine.close();
}

Затем при запуске java либо установите LD_LIBRARY_PATH для enclude JRI или установить - Джава.библиотека.путь eg

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib/R/site-library/rJava/jri/

Или

java -Djava.library.path=/usr/local/lib/R/site-library/rJava/jri/ MyMainClass