Как фильтровать массив numpy по списку индексов?
Я относительно новичок в python и пытаюсь научиться использовать numpy и scipy. У меня есть массив numpy, состоящий из данных LAS [x, y, z, интенсивность, классификация]. Я создал cKDTree точек и нашел ближайших соседей, используя query_ball_point. Я хотел бы найти стандартное отклонение значений z для соседей, возвращаемых query_ball_point, который возвращает список индексов для точки и ее соседей.
Есть ли способ фильтровать отфильтрованные _ _ строки для создания массива только из точек, индекс которых находится в списке, возвращаемом query_ball_point? Смотрите код ниже. Я могу добавить значения в список и вычислить std dev из этого, но я думаю, что было бы проще использовать numpy для вычисления std dev на одной оси. Заранее спасибо.
# Import modules
from liblas import file
import numpy as np
import scipy.spatial
if __name__=="__main__":
'''Read LAS file and create an array to hold X, Y, Z values'''
# Get file
las_file = r"E:Testingkd-tree_testingLE_K20_clipped.las"
# Read file
f = file.File(las_file, mode='r')
# Get number of points from header
num_points = int(f.__len__())
# Create empty numpy array
PointsXYZIC = np.empty(shape=(num_points, 5))
# Load all LAS points into numpy array
counter = 0
for p in f:
newrow = [p.x, p.y, p.z, p.intensity, p.classification]
PointsXYZIC[counter] = newrow
counter += 1
'''Filter array to include classes 1 and 2'''
# the values to filter against
unclassified = 1
ground = 2
# Create an array of booleans
filter_array = np.any([PointsXYZIC[:, 4] == 1, PointsXYZIC[:, 4] == 2], axis=0)
# Use the booleans to index the original array
filtered_rows = PointsXYZIC[filter_array]
'''Create a KD tree structure and segment the point cloud'''
tree = scipy.spatial.cKDTree(filtered_rows, leafsize=10)
'''For each point in the point cloud use the KD tree to identify nearest neighbors,
with a K radius'''
k = 5 #meters
for pntIndex in range(len(filtered_rows)):
neighbor_list = tree.query_ball_point(filtered_rows[pntIndex], k)
zList = []
for neighbor in neighbor_list:
neighbor_z = filtered_rows[neighbor, 2]
zList.append(neighbor_z)