Отключить сообщения При загрузке пакета

у меня есть пакет в R (ROCR), который мне нужно загрузить в моей среде R. При загрузке пакета печатается набор сообщений. Обычно это нормально, но поскольку вывод моего R-скрипта используется для дальнейшего анализа, я хочу полностью отключить все эти выходные данные. Как мне это сделать? Кроме того, я бы предпочел сделать это без необходимости изменять ROCR вообще, так что будущие пользователи этого скрипта тоже не должны этого делать.

Так далеко:

  • sink() здесь не работает-перенаправление как stdout, так и std err на /dev/null ничего не делает для меня.
  • неудивительно, options(warnings=-1) тоже ничего не делает, так как это не предупреждения, как таковые, печатаются.

какие мысли?

4 67
javascript messages

4 ответа:

просто использовать suppressMessages() вокруг library() звоните:

edd@max:~$ R

R version 2.14.1 (2011-12-22)
Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
[...]

R> suppressMessages(library(ROCR))
R>                                               # silently loaded
R> search() 
 [1] ".GlobalEnv"         "package:ROCR"         # it's really there      
 [3] "package:gplots"     "package:KernSmooth"
 [5] "package:grid"       "package:caTools"   
 [7] "package:bitops"     "package:gdata"     
 [9] "package:gtools"     "package:stats"     
[11] "package:graphics"   "package:grDevices" 
[13] "package:utils"      "package:datasets"  
[15] "package:methods"    "Autoloads"         
[17] "package:base"      
R>
111

library(ROCR, quietly = TRUE) может быть более элегантный вариант.

1

ответ Дирка подавляет все сообщения и не относится к сообщениям, которые генерируются при загрузке пакетов.

решение:

suppressPackageStartupMessages(library(THE_PACKAGE_NAME))

немного более подробное объяснение можно найти здесь

1

добавлять quietly = T как показано ниже, решить проблему:

suppressWarnings(suppressMessages(library("dplyr", quietly = T)))

в случае нескольких пакетов вы можете использовать:

## specify the package names
PKGs <- c("affy","gcrma","readxl","ggplot2","lattice" )

и они используют lapply, как показано ниже:

lapply(PKGs, library, character.only = TRUE ,quietly = T)
0