Преобразование фрейма данных в данные.таблица без копии

у меня есть большой фрейм данных (в порядке нескольких ГБ), который я хотел бы преобразовать в data.table. Используя as.data.table создает копию фрейма данных, что означает, что мне нужна доступная память, чтобы быть по крайней мере в два раза больше данных. Есть ли способ сделать преобразование без копии?

вот простой пример для демонстрации:

library(data.table)
N <- 1e6
K <- 1e2
data <- as.data.frame(rep(data.frame(rnorm(N)), K))

gc(reset=TRUE)
tracemem(data)
data <- as.data.table(data)
gc()

С выход:

library(data.table)
# data.table 1.8.10  For help type: help("data.table")
N <- 1e6
K <- 1e2
data <- as.data.frame(rep(data.frame(rnorm(N)), K))

gc(reset=TRUE)
# used  (Mb) gc trigger   (Mb)  max used  (Mb)
# Ncells    303759  16.3     597831   32.0    303759  16.3
# Vcells 100442572 766.4  402928632 3074.2 100442572 766.4
tracemem(data)
# [1] "<0x363fda0>"
data <- as.data.table(data)
# tracemem[0x363fda0 -> 0x31e4260]: copy as.data.table.data.frame as.data.table 
gc()
# used  (Mb) gc trigger   (Mb)  max used   (Mb)
# Ncells    304519  16.3     597831   32.0    306162   16.4
# Vcells 100444242 766.4  322342905 2459.3 200933219 1533.0
1 62
javascript dataframe reference data.table

1 ответ:

С В1.9.0+. От новости:

o следование этот С. О. в должности, функция setDT теперь реализовано, что принимает list (по имени и/или unnamed), data.frame (или data.table) в качестве входных данных и возвращает тот же самый объект как data.tableпо ссылке (без копирования). Смотрите ?setDT примеры для более.

в соответствии с data.table соглашение об именах-все set* функции изменяются по ссылке. := является единственным другим, который также изменяется по ссылке.

require(data.table) # v1.9.0+
setDT(data) # converts data which is a data.frame to data.table *by reference*

см. историю для более старых (теперь устаревших) ответов.

71